Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB19A4D1S5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms