Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMX2A2RU54 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms