Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2D9

IGKV1D-13, Immunoglobulin kappa variable 1D-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1D-13A0A0B4J2D9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms