Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC9Q9Y397 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZDHHC9Q9Y397 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZDHHC9Q9Y397 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZDHHC9Q9Y397 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZDHHC9Q9Y397 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms