Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNQ9UQP3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNQ9UQP3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms