Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNAL1Q9UBT7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms