Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNRD1Q9P1U0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms