Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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