Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms