Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms