Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ZRANB3-203ENST00000403017 4130 ntTSL 55.77□□□□□ -1.498e-12■■■■■ 179.7
UTP3Q9NQZ2 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.518e-12■■■■■ 179.7
UTP3Q9NQZ2 PIEZO1-215ENST00000566414 564 ntTSL 418.72■□□□□ 0.591e-13■■■■■ 179.6
UTP3Q9NQZ2 NRBP2-206ENST00000530347 1037 ntTSL 520.53■□□□□ 0.882e-21■■■■■ 179.5
UTP3Q9NQZ2 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-16■■■■■ 179.5
UTP3Q9NQZ2 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.136e-9■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.993e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-211ENST00000497582 1075 ntTSL 323.96■■□□□ 1.433e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-206ENST00000435310 507 ntTSL 217.09■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 CYSTM1-204ENST00000509789 813 ntTSL 414.89□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 CYSTM1-202ENST00000504227 588 ntTSL 514.89□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-210ENST00000495205 971 ntTSL 513.98□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-207ENST00000455367 487 ntTSL 511.62□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-205ENST00000414605 545 ntTSL 211.55□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 CYSTM1-203ENST00000509589 665 ntTSL 310.93□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 AC087633.2-204ENST00000621842 496 ntTSL 510.79□□□□□ -0.683e-9■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 AC087633.2-205ENST00000615751 500 ntTSL 56.99□□□□□ -1.293e-9■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 LCLAT1-211ENST00000491680 1610 ntTSL 212.12□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 LCLAT1-209ENST00000478015 1862 ntTSL 210.97□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 LCLAT1-202ENST00000319406 2774 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 179.3
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-211ENST00000635142 5548 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 179.2
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 179.2
UTP3Q9NQZ2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 179.2
UTP3Q9NQZ2 POLR3GL-203ENST00000471706 755 ntTSL 523.48■■□□□ 1.353e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.353e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.524e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.244e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.234e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 POLR3GL-204ENST00000622508 1600 ntTSL 1 (best)15.46■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -04e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FOS-207ENST00000555672 834 ntTSL 214.31□□□□□ -0.124e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FOS-210ENST00000557139 249 ntTSL 514.05□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 AC243547.3-202ENST00000625258 192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.513e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.844e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.124e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 SNX29-201ENST00000562510 536 ntTSL 38.05□□□□□ -1.124e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.194e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.34e-9■■■■■ 179.1
UTP3Q9NQZ2 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 179
UTP3Q9NQZ2 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 179
UTP3Q9NQZ2 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 179
UTP3Q9NQZ2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 METTL22-201ENST00000163678 1510 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 ARID4B-211ENST00000474953 3463 ntTSL 215.01□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 RBM34-203ENST00000447801 1273 ntTSL 514.02□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 RBM34-202ENST00000429912 667 ntTSL 313.69□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 RBM34-208ENST00000485019 409 ntTSL 313.69□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 RBM34-209ENST00000486751 783 ntTSL 213.69□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 RBM34-205ENST00000474086 882 ntTSL 212.43□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 METTL22-202ENST00000381920 4984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 RBM34-207ENST00000476261 881 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 178.9
UTP3Q9NQZ2 RANBP10-205ENST00000602638 1248 ntTSL 226.95■■□□□ 1.95e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.485e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.235e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RPL35-203ENST00000487431 785 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.24e-10■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.115e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.115e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RANBP10-203ENST00000602506 2756 ntTSL 219.71■□□□□ 0.755e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 FBXO22-208ENST00000569054 782 ntTSL 519.37■□□□□ 0.696e-12■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.14e-10■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.14e-10■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RPL35-204ENST00000493018 692 ntTSL 314.49□□□□□ -0.094e-10■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RANBP10-204ENST00000602525 1353 ntTSL 212.49□□□□□ -0.415e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 FTO-210ENST00000612285 1852 ntTSL 510.95□□□□□ -0.667e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.777e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 FTO-211ENST00000635892 1085 ntTSL 59.95□□□□□ -0.827e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.834e-10■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 FBXO22-203ENST00000561885 722 ntTSL 57.6□□□□□ -1.196e-12■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.217e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.287e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 FTO-201ENST00000268349 2799 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.327e-8■■■■■ 178.8
UTP3Q9NQZ2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 178.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC16-203ENST00000375849 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 178.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 178.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC16-205ENST00000475133 6299 ntTSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 178.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 178.6
UTP3Q9NQZ2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.897e-11■■■■■ 178.6
UTP3Q9NQZ2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.457e-11■■■■■ 178.6
UTP3Q9NQZ2 RAB7A-207ENST00000491681 552 ntTSL 25.55□□□□□ -1.527e-11■■■■■ 178.6
UTP3Q9NQZ2 IFT140-206ENST00000565298 4727 ntTSL 222.27■■□□□ 1.168e-7■■■■■ 178.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-210ENST00000557827 877 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 178.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-216ENST00000559496 1381 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 178.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-215ENST00000559476 1205 ntTSL 27.6□□□□□ -1.198e-7■■■■■ 178.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-225ENST00000606671 571 ntTSL 47.3□□□□□ -1.248e-7■■■■■ 178.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-221ENST00000561061 970 ntTSL 1 (best)7.01□□□□□ -1.298e-7■■■■■ 178.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-224ENST00000606161 482 ntTSL 35.58□□□□□ -1.528e-7■■■■■ 178.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.548e-7■■■■■ 178.5
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