Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPHNQ9NQX3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPHNQ9NQX3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms