Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI5

NMRK2, Nicotinamide riboside kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK2Q9NPI5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NMRK2Q9NPI5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMRK2Q9NPI5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms