Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FZD3Q9NPG1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FZD3Q9NPG1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms