Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSU72Q9NP77 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms