Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK-5Q9HDB9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms