Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms