Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms