Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF3BQ9BZI7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF3BQ9BZI7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms