Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms