Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SORCS2Q96PQ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms