Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC43Q96MW1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms