Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH8Q96L42 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH8Q96L42 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms