Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms