Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TPD52L3Q96J77 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms