Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms