Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LINC00526Q96FQ7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms