Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPUSD4Q96CM3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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