Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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