Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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C11orf40Q8WZ69 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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C11orf40Q8WZ69 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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C11orf40Q8WZ69 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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C11orf40Q8WZ69 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C11orf40Q8WZ69 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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C11orf40Q8WZ69 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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C11orf40Q8WZ69 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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