Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCG2

PI4K2B, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2BQ8TCG2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4K2BQ8TCG2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms