Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF548Q8NEK5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF548Q8NEK5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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