Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71E2Q8N5Q1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms