Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLD3Q8IV08 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLD3Q8IV08 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms