Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms