Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG9AQ7Z3C6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG9AQ7Z3C6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms