Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms