Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC25A48Q6ZT89 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC25A48Q6ZT89 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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