Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms