Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM78BQ5VT40 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM78BQ5VT40 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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