Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf220Q5T0J3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms