Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC158Q5M9N0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms