Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DUSP28Q4G0W2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms