Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms