Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf21Q32NC0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms