Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FXNQ16595 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FXNQ16595 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FXNQ16595 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FXNQ16595 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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