Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIP10Q15642 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms