Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SF1Q15637 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SF1Q15637 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SF1Q15637 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SF1Q15637 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms