Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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