Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDK3Q15120 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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